डीन के हटाए जाने के तुरंत बाद, संस्थान के निदेशक ने भी अपने पद से इस्तीफा दे दिया, यह कहकर कि वह वर्तमान परिस्थितियों में संस्थान के बेहतर संचालन में बाधा बन सकते हैं। इस कदम से छात्रों में गहरी असंतुष्टि उत्पन्न हुई।

छात्र संघों ने इस इस्तीफे को प्रशासन की अनैतिक कार्यवाही का परिणाम बताया और तत्काल पुनर्विचार की मांग की। उन्होंने कैंपस के मुख्य द्वार पर शांतिपूर्ण धरना दिया, जहाँ उन्होंने संस्थान के प्रबंधन से निदेशक के इस्तीफे को वापस लेने और एक पारदर्शी प्रक्रिया अपनाने का आग्रह किया।

आईआईटी बॉम्बे के प्रिंसिपल ने कहा कि संस्थान के सभी निर्णय संस्थागत नियमों और राष्ट्रीय शिक्षा नीति के अनुरूप होते हैं, और उन्होंने छात्रों के विचारों को सुनने के लिए एक खुला मंच आयोजित करने का प्रस्ताव रखा है।

इस बीच, कई शैक्षणिक विशेषज्ञों ने कहा कि ऐसी स्थिति में संवाद और पारदर्शिता ही समाधान की कुंजी है, और उन्होंने प्रशासन को छात्रों के साथ मिलकर एक स्थायी समाधान निकालने की सलाह दी।